정부로부터 청산 명령을 받은 엑스포과학공원은 지난 1990년 '대전엑스포93' 준비 단계에서 사후활용 방안이 확정된다. 

당시 국무 총리실은 박람회장의 상설전시구역을 공원으로 조성하기로 하고 공원 운영은 재단이, 경영은 민간업체가 맡기로 결정한다. 

이 같은 국무총리실의 결정은 93엑스포가 끝난 이후 94년부터 97년 까지 컨소시엄으로 구성 된 엑스피아월드에서 과학 공원을 운영하는 계기를 만들었으나 이후 양측은 부실경영을 상대 책임으로 돌리다 재판까지 가는 우여곡절을 겪는다. 

현 대전시 김영관 정무부시장은 엑스피아월드 전무이사를 거쳐 97년 대표이사를 맡다 2006년 (주)대교 자회사인 베텔스만 대표이사로 있으면서 엑스포과학공원측과의 소송에서 승소해 과학공원은 280억 원을 엑스피아월드에 배상하게 되는데 과학공원측은 이 때문에 재정에 상당한 손실을 입게 된다. 

93년에 설립된 엑스포기념재단은 98년 과학공원 민간 매각을 시도했으나 엑스피아월드 컨소시엄의 대주주인 (주)대교 한 곳에서만 매각예정가격 2,058억 원에 훨씬 못 미치는  약 800억 원에 응찰해 민간 매각이 무산 됐다. 

이후 산업자원부는 98년 말 기념재단법을 폐지하고 980억원이 포함 된 과학공원의 자산을 대전광역시로 무상양여 하게 된다. 

결국 99년 7월 설립된 지방공사엑스포과학공원은 2,263억 원의 현물과 함께 산자부로부터 물려 받은 자산으로 출범해 지금까지 10년 가까이 엑스포과학공원을 운영해 왔다. 

엑스포과학공원은 초대 오덕균 이사장을 비롯해 수많은 수장들이 왔다 갔으나 단 한 명도 '과학공원 활성화'라는 임무를 수행하지 못하고 물러나 '고위 공무원의 무덤'이라는 악명을 떨치게 된다. 

오덕균 이사장이 6,500만원의 예산으로 충남대지역개발연구소에 과학공원활성화 관련 용역을 준 것을 시작으로 ▲과학공원시설 구조 변경 ▲과학공원활성화 마스터플랜 기본계획 ▲과학공원 리컨스트럭션 계획 ▲과학공원 에코토피아 계획 등 용역을 의뢰 했으나 모두 '재원조달 한계로 추진무산', '수익성 불투명 이유로 추진유보', '국비유치 부진으로 미활용' 등 결론만이 나온다. 

이 뿐만이 아니다. 엑스포과학공원은 공원 활성화에 대한 부분적인 검토용역도 수차례 실시했지만 용역의뢰비만 날렸을 뿐 '장기적 추진, 고객유인 곤란, 흥미유발 곤란'이라는 진단만 받는다. 

또한 대전시와 엑스포과학공원은 사장이 바뀔 때 마다 활성화 계획을 내 놓으며 총 다섯 차례에 걸쳐 대대적인 홍보까지 했으나 결국은 발표만 있을 뿐 제대로 실천 된 것은 전무하다고 할 정도로 가시적 성과를 내지 못했다. 

일단 청산이라는 상황까지 오게 된 데에는 대전시와 엑스포과학공원의 공동책임이 크지만 과학공원 관계자뿐만 아니라 일반 시민들까지도 청산을 결정한 정부와 대전시의 안일한 시각에 비판을 보내고 있다. 

과학공원은 그야말로 국민 교육의 장인 과학공원이지 수익사업을 내는 곳이 아니라는 게 이들의 한결같은 지적이다. 수익사업으로 이익을 낼 수 없는 구조 하에서 일정부분 적자는 불가피 하며 매년 1백만 명의 관람객을 유치 했다는 게 과학공원 관계자의 설명이다. 

이들은 대전시에서 과학공원 활성화에 예산이 들어가는 일은 시도하지도 않았다고 지적 한 뒤 자체 예산으로 버텨오며 이제는 적자폭을 줄여 나가고 있는데 갑자기 청산 결정을 내린 정부에 대한 서운한 감정도 그대로 드러냈다. 

또한 최근 임명된 한의현 사장의 직원감축안이 실행 됐을 경우 내년도에 예상되는 25억 원 적자를 대부분 메워 대전시가 '청산'대신 '1년간 유예 후 재평가'만 받아냈더라도 엑스포과학공원은 생존 할 수도 있었다는 게 주변의 평가다. 

결국, 엑스포과학공원이 정부로부터 청산이라는 진단을 받은 것은 '활성화'라는 임무를 수행해내지 못한 전, 현직 사장단과 대전시의 공동 책임으로 보이며 과학공원 개장 초기에 운영을 도맡았다가 활성화는 시키지 못한 채 소송까지 진행해 수백억 원을 받아 간 엑스피아월드도 일정부분 책임을 져야 한다는 게 중론이다. 

하지만 문제는 책임 이후다. 

대전시에서는 ‘청산’이라는 정부의 결정이 나자마자 ‘상업지구로 용도 변경 할 수 있다’는 입장을 밝히며 난개발을 하려는 듯한 인상을 주자 시민단체는 엑스포과학공원 부지는 단 한 평도 대전시민들로부터 뺏어 갈 수 없다는 입장을 밝히며 대립각을 세우고 있어 과학공원 청산 이후를 두고 당분간 공방이 이어 질 것으로 예상된다. 

일부에서는 차기 대전시장 선거에서 공약으로 내 건 후에 토지의 용도변경을 해야 한다고 말할 정도로 엑스포과학공원 활성화 계획은 대전의 미래도시기능을 결정 지을 중요한 사안으로 떠오르고 있다.